Las bacterias no viven aisladas: cooperan, compiten y se regulan en red. Modelar esas interacciones es la base de nuestro nuevo desarrollo de Redes Microbianas, que pasa de la abundancia relativa a la arquitectura del ecosistema.
De la co-ocurrencia a la causalidad
La mayoría de los análisis de microbiota se quedan en listas de abundancias: qué especies están presentes y en qué proporción. Es información necesaria, pero incompleta. Nuestro modelo de redes va un paso más allá e identifica relaciones de co-exclusión y co-ocurrencia entre taxones, aproximando qué especies se favorecen o se inhiben mutuamente dentro de un mismo ecosistema.
El resultado no es un listado plano, sino un grafo: nodos que representan taxones y aristas ponderadas que representan la fuerza y el signo de la interacción estimada. Ese grafo es lo que convierte un informe descriptivo en un mapa de mecanismos.
Un ecosistema no se entiende contando especies, se entiende viendo cómo se relacionan entre sí.
Cómo se construye la red
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- Perfilado taxonómico de alta resolución sobre la muestra secuenciada por long-read.
- Estimación de correlaciones robustas entre abundancias, corregidas por composicionalidad.
- Filtrado estadístico de aristas espurias y validación cruzada contra el cohorte de referencia.
- Anotación funcional de los nodos clave (hubs) que sostienen la estabilidad de la red.
Aplicación en investigación clínica
El desarrollo está basado en artículos publicados por nuestro equipo de Ensayos Clínicos, con adaptabilidad a estudios poblacionales y seguimiento longitudinal de cohortes, integrado directamente en el Informe de Microbiota. Un grupo de investigación puede así comparar la topología de red entre grupo control e intervención, no solo sus abundancias medias.
Seguridad alimentaria
Las mismas redes tienen un uso potencial en la seguridad de la cadena de suministro alimentario: detectar desequilibrios de red asociados a contaminación o alteración microbiana temprana, antes de que sean visibles en un recuento simple de patógenos.
Próximos pasos
Redes Microbianas está en fase de I+D avanzada y comenzará a integrarse en el Informe de Microbiota para grupos de investigación seleccionados durante el segundo semestre de 2026. Si tu grupo trabaja con cohortes longitudinales y quiere ser parte del piloto, contacta con nuestro equipo científico.
